特定转录因子与已知启动子区域的结合（Direct ChIP）；在已知启动子的大片段范围内寻找特定转录因子的结合位点(ChIP-Scaning)；在基因组范围内搜寻特定转录因子；结合的所有启动子片断。

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焦磷酸测序技术（Pyrosequencing）作为一种新的序列分析技术，能够快速地检测甲基化的频率，对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测，为甲基化研究提供了新的途径。QIAGEN PyroMark

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RNA原位核酸杂交又称RNA原位杂交。该技术是指运用cRNA或寡核苷酸等探针检测细胞和组织内RNA表达的一种原位杂交技术。

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